Datos de la Actividad:
Duración: 4 horas
Días: 25 de Marzo 2015
Horario: 16:00-20:00 horas
Lugar: Sala de ordenadores FARMAC. Facultad de Farmacia
Nº de Plazas: 20
Enfocado a: Docentes, investigadores, personal investigador en formación, alumnos y personal técnico que no tengan ningún conocimiento en bioinformática y deseen adquirir conceptos e iniciarse en el uso de herramientas básicas.
Conocimientos previos: Conocimientos de informática a nivel de usuario (Internet, e-mail, MS Word…). Es deseable, pero no imprescindible haber participado en el curso anterior “Bioinformática para principiantes: análisis de secuencias nucleotídicas (DNA)”
Objetivos:
-Adquisición de conocimientos en conceptos básicos para el análisis bioinformático de proteínas.
-Manejar las distintas herramientas bioinformáticas disponibles, software y online.
-Búsqueda en bases de datos públicas.
Contenidos:
- Introducción a la bioinformática. Ventajas de trabajar con secuencias proteicas respecto a las nucleotídicas.
- Formatos de secuencias proteicas.
- Bases de datos. Comparación de secuencias.
- Alineamiento múltiple de secuencias proteicas.
- Predicción de dominios proteicos.
- Modelización y predicción de estructura proteica.
- Ejemplos prácticos.
Metodología/Programación:
16:00 h - Introducción a la bioinformática. Ventajas de trabajar con secuencias proteicas respecto a trabajar con secuencias nucleotídicas.
16:30 Formatos de secuencias proteicas. Conversión de secuencias nucleotídicas a proteicas.
17:15 Bases de datos. Comparación de secuencias. Introducción a BLAST. Ejemplos prácticos.
18:00 Descanso.
18:30 Alineamiento múltiple de secuencias proteicas. Programas de alineamiento múltiple. Uso práctico.
19:15 Predicción de dominios proteicos. Uso práctico de programas online de predicción de dominios.
19:30 Modelización y predicción de estructura proteica. Ejercicio de modelización de una secuencia proteica.
NOTA: Si el curso se llena y están interesado en realizarlo, manda un mail a fercb@usal.es indicando tu nombre completo y entrarás en la lista de espera. Si alguna plaza quedara libre, se te mandaría un correo para confirmar tu asistencia.
