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Secuencias proteicas: iniciación al análisis mediante programas bioinformáticos.

  • Fechas:

    Del 14/03/17 al 14/03/17

  • Lugar:

    Aula MAC, FACULTAD DE FARMACIA, Salamanca, España (mapa)

Web del evento

Descripción ↑ subir

Título del curso/taller: Secuencias proteicas: iniciación al análisis mediante programas bioinformáticos.

Profesorado:

Nombre: Dr. Raúl Rivas González

Departamento: Microbiología y Genética

Correo electrónico: raulrg@usal.es

Nombre: José David Flores Félix

Departamento: Microbiología y Genética

Correo electrónico: jdflores@usal.es

Datos de la Actividad:

Duración: 2 horas

Días: 14 de Marzo 2017

Horario: 16:00-18:00 horas

Lugar: Sala MAC. Facultad de Farmacia

Nº de Plazas: 15

Enfocado a: Alumnos de los grados de Farmacia, Biología, Ciencias Ambientales, Química, Biotecnología y otras titulaciones de ciencias, así como personal investigador en formación, investigadores, personal técnico y docentes interesados en la materia, que no tengan ningún conocimiento en bioinformática y que deseen adquirir conceptos y aprender herramientas básicas relacionadas.

Conocimientos previos: Conocimientos de informática a nivel de usuario (Internet, e-mail, MS Word…). Es deseable, pero no imprescindible haber participado en el curso anterior sobre análisis de secuencias de ADN.

Objetivos:

-Adquisición de conocimientos en conceptos básicos para el análisis bioinformático de proteínas.

-Manejar las distintas herramientas bioinformáticas disponibles, software y online.

-Búsqueda en bases de datos públicas.

Contenidos:

- Introducción a la bioinformática. Ventajas de trabajar con secuencias proteicas respecto a las nucleotídicas.

- Formatos de secuencias proteicas.

- Bases de datos. Comparación de secuencias.

- Alineamiento múltiple de secuencias proteicas.

- Predicción de dominios proteicos.

- Modelización y predicción de estructura proteica.

- Ejemplos prácticos.

Metodología/Programación:

16:00 h - Introducción a la bioinformática. Ventajas de trabajar con secuencias proteicas respecto a trabajar con secuencias nucleotídicas.

16:15 Formatos de secuencias proteicas. Conversión de secuencias nucleotídicas a proteicas.

16:30 Bases de datos. Comparación de secuencias. Introducción a BLAST. Ejemplos prácticos.

17:00 Alineamiento múltiple de secuencias proteicas. Programas de alineamiento múltiple. Uso práctico.

17:20 Predicción de dominios proteicos. Uso práctico de programas online de predicción de dominios.

17:40 Modelización y predicción de estructura proteica. Ejercicio de modelización de una secuencia proteica.

Programas/Utilidades necesarias:

Todos los programas utilizados son gratuitos y están disponibles online.

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Programa ↑ subir

Datos de la Actividad:

Duración: 2 horas

Días: 14 de Marzo 2017

Horario: 16:00-18:00 horas

Lugar: Sala MAC. Facultad de Farmacia

Nº de Plazas: 15

Enfocado a: Alumnos de los grados de Farmacia, Biología, Ciencias Ambientales, Química, Biotecnología y otras titulaciones de ciencias, así como personal investigador en formación, investigadores, personal técnico y docentes interesados en la materia, que no tengan ningún conocimiento en bioinformática y que deseen adquirir conceptos y aprender herramientas básicas relacionadas.

Conocimientos previos: Conocimientos de informática a nivel de usuario (Internet, e-mail, MS Word…). Es deseable, pero no imprescindible haber participado en el curso anterior sobre análisis de secuencias de ADN.

Objetivos:

-Adquisición de conocimientos en conceptos básicos para el análisis bioinformático de proteínas.

-Manejar las distintas herramientas bioinformáticas disponibles, software y online.

-Búsqueda en bases de datos públicas.

Contenidos:

- Introducción a la bioinformática. Ventajas de trabajar con secuencias proteicas respecto a las nucleotídicas.

- Formatos de secuencias proteicas.

- Bases de datos. Comparación de secuencias.

- Alineamiento múltiple de secuencias proteicas.

- Predicción de dominios proteicos.

- Modelización y predicción de estructura proteica.

- Ejemplos prácticos.

Metodología/Programación:

16:00 h - Introducción a la bioinformática. Ventajas de trabajar con secuencias proteicas respecto a trabajar con secuencias nucleotídicas.

16:15 Formatos de secuencias proteicas. Conversión de secuencias nucleotídicas a proteicas.

16:30 Bases de datos. Comparación de secuencias. Introducción a BLAST. Ejemplos prácticos.

17:00 Alineamiento múltiple de secuencias proteicas. Programas de alineamiento múltiple. Uso práctico.

17:20 Predicción de dominios proteicos. Uso práctico de programas online de predicción de dominios.

17:40 Modelización y predicción de estructura proteica. Ejercicio de modelización de una secuencia proteica.

Programas/Utilidades necesarias:

Todos los programas utilizados son gratuitos y están disponibles online.

Ponentes ↑ subir

Profesorado:

Nombre: Dr. Raúl Rivas González

Departamento: Microbiología y Genética

Correo electrónico: raulrg@usal.es

Nombre: José David Flores Félix

Departamento: Microbiología y Genética

Correo electrónico: jdflores@usal.es

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